长久以来，有人认为「净土不应独立成宗」1，因为：「净为三乘共庇」，此说看似有理，却不符合历史发展的事实2，也不善体弥陀救度一切众生的大悲弘愿，及末法众生唯能仰靠弥陀的迫切需要；因此，净土法门的真义与大利被一般化而忽视了。幸而，有许多精通三藏、善观因缘的菩萨祖师，深见末法众生的根机与需求，而独具手眼的抉择判释一代法教，於大乘诸宗揭出净土教门，乃至於统摄诸宗归入净土，完成了净土宗的纯化与独立，让释尊出世本怀在中国彻底圆彰而光明遍照，这过程虽然曲折起伏，亦有其教化之意义。念佛生净土始终是易行难信之法，千百年来附属於圣道门，被台、贤、禅各宗分别以其宗学教理来诠释，夹杂了种种自力修证的观念与行法；而这种混融与夹带，对於净土门的慕道者，是额外的负担与障碍，甚至因此心生焦虑，知难而退，诚可叹息！
太虚大师说：「律为三乘共基，净为三乘共庇。」但历史上南山律不仅独立成宗，且到了民初有弘一大师弘传此宗3；净土在善导、少康两大师之时曾自立其宗4，民初也有印光大师5导归此宗。两宗的主要文献皆曾失传，皆於清末从日本请回，重新发扬。因此，善导系净土宗的复兴并独立，於今日或乃最佳时机，也责无旁贷6。
若不名为（狭义的）宗，则可称为（广义的）门；前者在一般佛教史上是八宗并立，净土只居其一，其地位相对的局促；後者乃圣净判教之门（可通入路） 7，净土与圣道（七宗或诸宗）平分，其门户或许更开广。
若泥於「净土为三乘共庇」而不应独立，永远寓於他宗，则成了隐晦、迂回——所谓「教」在贤首（天台、唯识），「行」在弥陀（净土）；或「参究」念佛，禅净双修8……，虽表面上说「净土统摄三乘」，其实是各以自宗的义学对净土做了不同的取舍，让净土宗的面目模糊而失真。这种「教、行」混搭，不只「体性」不合，且「宾主」错乱，看似藉「贤台禅」的妙理可抬高「净土」的行果，以争取「上品上生」的品位，但这或许是诸宗自我暗示的理想。若依净土三经的教示，各类众生（智愚、贵贱、戒罪……）9唯依（弥陀）本愿念佛而直入（涅盘）报土，皆平等的莲花化生，无差别相「且智慧高明，神通洞达，咸同一类」10，生前修学「贤台禅」所得功德，与守愚无知的纯一念佛，差别极小，有时反而是杂用心，教观（义学）虽高而美、深而妙，却不相应於行持（称名）的简易、平实。《法然上人全集》：
我立净土宗之元意，为显示「凡夫往生报土」也。……诸宗所谈，其趣虽异，总而论之，不许凡夫往生报土。是故我依善导释义建立宗门，以明凡夫生报土之义也。然人多诽谤云：「劝进念佛往生，何必别开宗门？岂非为胜他耶！」如此之人，未知旨也。若不别开宗门，何显「凡夫生报土」之义乎！（净土随闻记（二））
这段话一针见血、义正辞严地说出「净土独立成宗」的明确性与必要性，中国宋明以来的诸宗诸派，虽也弘讲「念佛往生」，但多半（如天台宗）认为极乐净土高胜、微妙，是菩萨大圣修行所到的境界，一般凡夫只能往生浅近的「凡圣同居土」，因此，「本愿称名，凡夫入报」的弥陀悲愿与净土特色，就被抹灭、被埋藏了，因此，为了重现弥陀净土的超世愿他力救度，也为了恢复众生念佛的不思议摄取往生，就有必要排除一切杂音，纯以善导大师的（净土）教理与教相来建立宗门，才能自在的显明「凡夫生报土」之义。
从上述的佛教史来看，世事或如《三国演义》开篇: 「话说天下大势，分久必合，合久必分。」在中国佛教界，净土宗与其余诸宗的关系，似乎也如此：1.分久必合：教在台贤，行在净土→→2.合久必分：分河饮水11，各自是非。
前者乃为了对治时代的弊病，而主张「合则双美」；後者则为了还原法门的特色，须了知「合则两伤」。印光大师於「儒、佛」二教及「因果、心性」皆云「合之则双美．离之则两伤」12，唯於「通途（圣道）、特别（净土）」二门，则云「不可并论」、不可「以通途教理，论特别法门」、「各别论之则有益，混融论之则有损」、「离则两益，合则两害」、「依普通法门论净土法门，由兹自误误人」。引文如下：
念佛一法，彻上彻下，即权即实，即渐即顿，不可以寻常教理批判（增广上‧覆马契西居士书二）
通宗通教之士，反漠然置之，若不闻知者然。其故何在？以研教者按常途教理以论断证，不信有带业往生之事。（增广下‧普贤行愿品疏钞撷序）
净土法门，乃一代时教中之特别法门，不可以与通途法门并论。若不明此义，以仗自力通途法门之义，疑仗佛力特别法门之益，而不肯信受，则其失大矣。佛说难信，盖即指此。（增广下‧阿弥陀经白话解释序）
如来一代时教所说一切法门，皆令众生修戒定慧，断贪瞋痴。了幻妄之生死，证真常之心性者。然众生根有利钝，惑有厚薄。……此系依通途教理修持而论，乃仗自己修戒定慧力，断尽贪瞋痴烦惑者，其难也难如登天。……唯念佛法门，全仗阿弥陀佛大慈悲愿力，若具真信切愿，至诚恳切，念佛名号，求生西方者，无论根之利钝、惑之厚薄，皆可於现生临命终时，蒙佛慈力亲垂接引，往生西方。既往生已，见思烦恼，不断而断。以西方极乐世界境缘殊胜，一一皆能增长人之功德智慧，绝无令人起贪瞋痴者。此如来一代时教中之特别法门，不得以通途教理而论。世有深通宗教，不信净土法门者，盖以通途教理，论特别法门也。使彼知是特别法门，则自行化他，莫敢或违矣。（三编下‧一切念佛人往生及不往生之证据）
净土法门，不可以《金刚经》之道理及禅宗之道理论。各别论之则有益，混融论之则有损。（三编上‧覆东海居士书）
净土，乃特别法门。其余，乃通途法门。离则两益，合则两害。（三编下‧上海法藏寺念佛开示）13
净土法门乃佛法中之特别法门，其利益与普通法门大不相同。古今多有依普通法门论净土法门，由兹自误误人而又自谓宏法利生者，不胜其多。其最初错点，在不察佛力与自力之大小难易。以仗佛力之法门，硬引仗自力之法门，而欲平论，致有此失。使知佛力不可思议，不能以具缚凡夫修持之力，相为平论，则凡一切疑惑不信之心，化为乌有。（续编上‧覆善觉大师书民国二十九年二月）
特别法门净土宗与通途（普通）法门诸宗之间，最易於混融（纠缠）而成了「双赢」或「两失」的，是禅与净的「合一」论14：理上「禅净圆融」、事上「禅净双修」，从永明禅师的《四料简》以来15，这个题目就争论不休，而印光大师对此亦有独到的见解16：禅与净土，理本无二。若论事修，其相天殊。禅非彻悟彻证， 不能超出生死。……古今宗师，彻悟而未彻证者，类多如此。良由惟仗自力，不求佛加，丝毫惑业不尽，生死决不能出。净土则具信愿行三，便可带业往生。一得往生，则永出生死。悟证者 顿登补处，未悟者亦证阿鞞。……彼不究法门之所以然，而妄以参禅之法破念佛，则是误用其意。
禅净二宗，归元是一，修法各别。禅以彻见本来面目为宗，净以信愿念佛求生为宗。（增广上‧覆汪雨木居士书）
宗门以开悟为事，净宗以往生为事。开悟而不往生者，百有九十。往生而不开悟者，万无有一。此义认不准，或致因求悟而反不以往生为事，则其误大矣。（三编上‧覆张曙蕉居士书八）
真修净土人，用不得禅家开示，以法门宗旨不同故。（增广上‧覆何慧昭居士书）
为今之计，宜屏除禅录，专修净业。於一尘不染心中，持万德洪名圣号。或声或默，无杂无间。必使念起於心，声入乎耳，字字分明，句句不乱。（增广上‧与海盐顾母徐夫人书代悟开师作）
禅宗名为教外别传，净土实为教内真传。须知即此真传，乃别传外之别传也。……切不可错认定盘星，高推禅宗，藐视净土。致令临命终时，业识茫茫，无本可据。（增广下‧通智法师公堂序代悟开大师作）
或分或合，各有道理，也各有着重，从有阿弥陀佛西方净土教以来，中国佛教界对该不该独立宗，就争论至今，仍无共识与定论，或许也不须强同一致，就继续两案并存，而学佛人可依其不同因缘的现实与信仰，而各取所需、各行其是吧。
从上所见，净土门以善导大师的思想为主为正，乃直抒释尊出世之本怀，乃易行速证、平等普摄之法门，不应掺杂圣道门之知见与功夫，令行者事万倍而功未半。是故，阿弥陀佛与善导大师普为堕入杂修困境的念佛人而悲而急，纯正的净土宗不能也不应长久被混淆，而失去广度十方众生的功能，印光大师之後，仍须有悲心慧眼的宗师出而整理弘传，这个因缘就显应在千禧年的21世纪初，以慧净法师为代表，专依善导大师法脉的教团，致力於恢复久寓他宗而面目模糊的净土宗，这个复兴之路的艰难，或可谓「补苴罅漏，张皇幽眇。寻坠绪之茫茫，独旁搜而远绍；障百川而东之，回狂澜於既倒」17并依当代时势及众生根机而订出六个宗旨18；从《大正藏》中整编净土三经以及龙树、天亲、昙鸾、道绰、善导本系祖典，并略作注解、讲述而出版流通，一步一脚印，踏实而坚定的走了十余年，着作与讲演同步，显正与破疑并行，平实的门风、浅易的教理以及信受得安心、念佛得往生的实效，让越来越多迷离失所的学佛人找到归宿，重回弥陀的怀抱，在法师与莲友同心合力的宣导下，略具教团的规模与成效，善导大师创建的净土宗思想重新显扬现於世，且教团逐渐扩大其影响力，华人世界信受奉行者日益增多，「光明遍照 十方世界，念佛众生，摄取不舍」的悲愿，再次焕发出光芒再次温暖了五浊末世的人心，闻信，随学者莫不因此心开意解，信愿持名，自知往生决定、成佛有望。如此自信教人信的辗转引导下，让更多更广的学人欢喜踊跃、携手踏上了念佛成佛的光明大道。
就纯而不杂的（本愿称名）念佛人，於独立的净土宗，须建立三点共识：
1.决不许以圣道门的学理（他宗他教）而诠释净土门教行
2.圣、净分流，各修其法之後，於他宗他教存而不论、敬而不评，合掌令欢喜
3.回归纯一净土门，坚定信念，不杂余想，专一称名毕命为期不为异学异见所动摇。
注释：
1 净土宗在佛教，是极重要且普遍流行的法门。太虚大师说：「律为三乘共基，净为三乘共庇。」 (戒律与净土是佛门各宗派都应修习而弘扬). 印顺导师说：「戒律与净土，不应独立成宗。」「戒律是三乘共同的基础，不论在家出家的学者，都离不开戒律。净土为大小乘人所共仰共趋的理想界，如天台、贤首、唯识、三论以及禅，都可以修净土宏扬净土。」戒律是三乘共同遵守的基础，在家或出家佛弟子，皆不应离戒。净土为大小乘人共仰共趋的最高理想。三论宗、华严宗、天台宗、法相唯识宗及禅宗，都可兼修净土行，弘扬净土宗。这是佛教学者共同的倾向，净土绝对不是囿限於某一宗派的。站在整个佛教的立场来说，净土宗是统摄三乘的。
2 末法时期须以称名念佛得救的看法，是道绰个人的主张，他从约机废立的观点，结合 《观无量寿佛经》「下品下生」的教示，发展出末法与净土门的关系。这一发展的结果，不仅让净土门得以独立成宗，亦确立了净土门的实践方向。依太虚、印顺一系的看法，戒律和净土是不应独立成宗而为中国佛教各家所奉持的共法。不过，各家对净土的取舍抉择，都鲜明地表示了自宗的立场。如天台、贤首均以判教的形式会通净土，但台宗详於观门和心具的说明，贤首则重於法界缘起和理事意义上的圆释。即使禅宗内部各家，对净土念佛的融摄也有相当复杂的不同。〈从弥陀净土信仰的汉化到净土宗的成立〉/净土信仰蔚然成风。千经万论指归净土，东西南北、四维上下，尽虚空遍法界，十方无量诸佛无不出广长舌盛赞弥陀净土，历代净土高僧大德也无不殚精竭虑，不遗余力，亲躬力践，着述立说，阐发幽微，弘仰净土。弥陀信仰深入到社会的各个阶层，说明了阿弥陀佛与此土众生深重的缘分！迄至今日，弥陀净土法门不但没过时，反而历久弥新，更大放异彩！其盛行之程度有过之而无不及。甚至有人说，净土宗不应独立成宗，其中很重要的原因就是净土法门是几乎所有学佛人必修的，可见净土法门是如何的深入人心！
3 南山三大部，南宋时失传，清末由徐蔚如居士从日本请回，於天津刻经处重刊。弘一大师一生弘扬净土不遗余力。他的佛学思想体系，是以华严为境，四分律为行，导归净土为果的。他对佛教戒律精专研学，与对净土行的认同，是相资为用、不可分裂的，都出於自己对佛法的真切体认。弘一大师念佛，并非为成就一己之私的利益，而是始终抱着「救济众生之宏愿」，甚至有「以身为抵押品，赎出一切恶道众生」的大无畏气概。因此，为了得到成就，必须要发大菩提心。他鼓励念佛学人多做慈善事业，认为此事业也能成为成佛的资粮。
4 善导在长安，少康在新定，念佛之声，盈於道路；其往生者，当不止百千万亿。（《印光大师文钞》续编.下《净土经圣贤录序》，民二十二年）善导少康，宏扬净宗；闾巷道路，佛声广播。 如唱秧歌，人人愿听；如传圣诏，各各遵行。（《印光大师文钞》三编.卷三，覆净善居士书）
5 印光大师的生平与思想/总归现代净土宗有二，一为隋唐净土，一为宋明净土：隋唐净土为传承龙树菩萨、天亲菩萨、昙鸾大师、道绰大师至善导大师一脉，完全依止《净土三经》；宋明净土为加入了天台、华严、禅宗的思想，其教理虽为丰富，但已非纯粹之净土思想。因佛教法难，善导大师着作於中国失传，使净土宗依附於他宗成为「寓宗」，失去净宗独立之纲格。直至清末，善导大师之着作由杨仁山居士经其日本友人之协助，引返中国。因民国之印光大师，曾见善导大师之着作，故於《文钞》以善导大师之思想解释净土，并誉为「所说当作佛说看」。今台湾之净土宗文教基金会为弘扬善导大师之净土思想，复兴善导大师之弘愿念佛。/净宗法师：印光大师《文钞》对善导大师的赞叹列成十条：赞大圣不测德、赞弥陀化身德、赞所说等佛德、赞观经四帖疏、赞楷定专修德、赞发明助念德、赞弘超诸宗德、赞化度普广德、赞至极慈悲德、赞悬护万代德。印光大师专弘净土，他的立场较多维护传统观念，而倾向於善导大师的净土思想。……从通途的净土门转到善导大师的专宗净土，这个弯是转得较大，印光大师起了宽缓转弯的作用，只有他这样的祖师，级别、德行的人，才可把握这个历史因缘，起到顺势导入的作用。
6 佛海居士，〈复兴净土宗和我们的责任〉
7 道绰大师《安乐集》：其圣道一种，今时难证。……当今末法，现是五浊恶世，唯有净土一门，可通入路。
8 龚晓康,〈参究念佛与禅净双修之辨〉、杨惠南,〈禅净双修的种类及其理论基础〉
9 法照大师：「彼佛因中立弘誓，闻名念我总迎来；不简贫穷将富贵，不简下智与高才；不简多闻持净戒，不简破戒罪根深；但使回心多念佛，能令瓦砾变成金。」
10《无量寿经》：「极乐国土，所有众生，无差别相；......其诸声闻、菩萨、人天，智慧高明，神通洞达，咸同一类，形无异状；....颜貌端正，超世稀有，容色微妙，非天非人。皆受自然虚无之身，无极之体。」
11 张雪松,《法雨灵岩：中国佛教现代化历史进程中的印光法师研究》：晚清以来，由於拟制宗族制度等原因，佛教界内「分河饮水，各自是非」的弊端很明显，从杨文会开始，就自觉地希望以「教在贤首，行在弥陀」等重构整合，来纠正教内「分河」的弊病。
12 《万善同归集》：「合之双美,离之两伤。」印光大师：「尽性学佛．方能尽伦学孔。尽伦学孔．方能尽性学佛。试观古今之大忠大孝．与夫发挥儒教圣贤心法者．无不深研佛经．潜修密证也。儒佛二教．合之则双美．离之则两伤。以世无一人不在伦常之内．亦无一人能出心性之外。具此伦常心性．而以佛之诸恶莫作．众善奉行．为克己复礼．闲邪存诚．父慈子孝．兄友弟恭之助。由是父子兄弟等．相率而尽伦尽性．以去其幻妄之烦惑．以复其本具之佛性．非但体一．即用亦非有二也。」《文钞》之《复安徽万安校长书》因果、心性，离之则两伤，合之则双美。故梦东云：「善谈心性者，必不弃离於因果，而深信因果者，终必大明乎心性。」（增广上‧与佛学报馆书）
13 智随法师：法门不同，宗旨迥异，不可一视同观。自视一法通、法法通者，尤当善思。佛本应机说法，因缘各自有别。各行有缘之法，各守本门宗旨，各得相应之益，方为善学法者。不可强作主宰，自视通家，妄欲圆融，拟议他法，如是则彼此具害、自损损他矣。
14 顾伟康《禅净合一流略》
15 (永明寿禅师)深恐後世学者，不明宗要，特作一四料简偈，俾知所趣。……禅与净土，乃约理约教而言，有禅有净土，乃约机约修而论。理教则二法了无异致，机修则二法大相悬殊。语虽相似，意大不同。极须着眼，方不负永明之婆心矣。（三编．卷四．上海护国息灾法会法语（第四日说成佛大因果并略释《四料简》要义）
16 印光大师嘉言录〈分禅净界限〉
17 唐.韩愈〈进学解〉：填补儒学的缺漏，阐发精深的道理；寻找那茫无头绪、行将失传的儒家道统，孤独地广泛搜寻，远远继承；阻止百川泛滥乱流，把它们引导向东流；力挽已经倾泻的狂澜回到正途。
18 一、组织净土宗之教理架构。二、确立净土宗之教界地位。三、建设净土宗之僧信教团。四、弘传净土宗之救度法门。五、推广净土宗之念佛生活。六、扩大净土宗之信仰领域。